作为求合体系列作品之一,本作最大的特色就是在求合体的基础上引入了进化图谱这一关键元素,在游戏过程中,玩家有如造物主一般,让低等级的生物不断合体产生新的高等生物,从最初的三叶虫到随后的始盗龙,再到后来的剑齿虎等等,而且搭配上不同的药水,这些生物还能够朝不同的分支进行进化。
其实三叶虫爱合体怎么玩的具体方法与求合体一样是一样的,三个或三个以上的相同生物相连在一起后便会合体进化成高阶的生物,同时玩家也能够赚取相应的分数,游戏共分为六大场景,当玩家赚取足够的分数时便能够解锁相应的场景,比较有特色的设定在于当动物合体进化时有一定几率产生粪便,粪便只能够通过植物合体才能够吸收,好吧,其实这个设定和求合体里面的猫咪类似。当屏幕被摆满生物时,则游戏结束了。
除了以上的三叶虫爱合体攻略中讲述的内容外,游戏的实验皿和求合体中的蓝色盘子一样,可以用来存放东西,而能量条则和求合体的步数一样,每放置一个道具就会降低一格能量,能量耗尽则无法进行游戏,只能通过内购或是等待它自行回复。游戏中的道具系统也基本和求合体相仿,而且价格相当昂贵。